In Duitsland Flutgraben geheten, stroomt door de Duitse deelstaat Noordrijn-Westfalen en de Nederlandse provincie Limburg. De beek ontspringt in de gemeente Heinsberg, kruist de Duits-Nederlandse grens bij Karken tussen Voorst en Posterholt en mondt bij Linne uit in de Maas. De lengte op Nederlands gebied is ongeveer 17,5 km.
Het gebied van de beek is in het beheer van het Waterschap Roer en Overmaas.
De Vlootbeek had van oorsprong een natuurlijke waterloop, tussen 1650 en 1653 werd het deel achter Kasteel Montfort gegraven om de omgeving van dit kasteel te ontwateren. De Vlootbeek is door het historische ontginningspatroon van grote cultuurhistorische waarde.
“Gezien de uitzonderlijke droge zomer van 2018, staat het laatste gedeelte van de Vlootbeek lopend door het grondgebied van Maasgouw, nagenoeg droog”.
In de bossen bij de Vlootbeek kunt u een ree of wild zwijn aantreffen. Ook vele vogels, waaronder spechten en nachtegalen, leven in het gebied. Verder komen er kikkers, padden, salamanders en zes soorten sprinkhanen voor, waarvan de gouden sprinkhaan het meest bijzonder is. Erg bijzonder is het voorkomen van het pimpernelblauwtje: deze vlinder is nergens anders in Nederland te vinden.
Het Vlootbeek dal zelf is historisch gezien ook erg interessant. Opgravingen hebben aangetoond dat er ongeveer 9000-10000 jaar geleden hier mensen op jacht gingen en hun voedsel verzamelden uit de natuur. Ook is er een groter basiskamp ontdekt waar men meer permanent verbleef en van waaruit men op jacht en voedseltochten ging.
De Vlootbeek mondt in Linne uit in de Maas.